
Curso de Introdução ao MATLAB
Acesso ao MATLAB no servidor
Para os que precisam deixar rodando scripts demorados do MATLAB no servidor.
Faça login na sua conta no servidor (ou sua máquina linux no laboratório):
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ssh usuario@ipmaquina
Mande o matlab rodar seu script:
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nohup matlab -nosplash -nodisplay -nodesktop < meuscript.m > output.log &
O nohup irá garantir que após sair da sua conta o MATLAB continue rodando.
No output.log será salvo os dados impressos na tela. Para ver o andamento (e ver se o script não teve falhas também) basta dar:
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less output.log
ou
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cat output.log
-nodisplay, -nosplash e -nodesktop garantem que a execução ocorra sem a abertura de janela gráfica do MATLAB.
O & garante que o terminal fique livre de volta para sair da sua conta usando exit.
Biblioteca do Roberto
SWeep
manage-fasta-files
Monique Schreiner - 04/06/2019
Funções úteis para lidar com arquivos FASTA no MATLAB como: concatenar fastas, separar um único fasta em vários, retirar sequências de espécies e genes específicos do arquivo fasta, listar espécies, listar gêneros, etc.
Algumas funções requerem MATLAB 2017 ou superior.
BIOINFO-TOOLS
Camila P Perico - 16/12/2019
Ferramentas e funções de Bioinformática e Inteligência Artificial:
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gaGo - Algoritmo Genético básico - Autor: Prof. Dr. Roberto T Raittz
Funções compatíveis com MATLAB e, algumas, com OCTAVE