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MATLAB

Sites Oficiais

Para acessar a documentação oficial para as funções disponíveis no MATLAB acesse:

 

https://www.mathworks.com/

​

 

E para tirar dúvidas na comunidade acesse:

 

https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/

Curso de Introdução ao MATLAB

Curso Introd. MATLAB

Acesso ao MATLAB no servidor

Acesso MATLAB servidor

Para os que precisam deixar rodando scripts demorados do MATLAB no servidor.

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Faça login na sua conta no servidor (ou sua máquina linux no laboratório):

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  • ssh usuario@ipmaquina

 

Mande o matlab rodar seu script:

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  • nohup matlab -nosplash -nodisplay -nodesktop < meuscript.m > output.log &

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O nohup irá garantir que após sair da sua conta o MATLAB continue rodando.

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No output.log será salvo os dados impressos na tela. Para ver o andamento (e ver se o script não teve falhas também) basta dar:

​

  • less output.log

ou

  • cat output.log

 

-nodisplay, -nosplash e -nodesktop garantem que a execução ocorra sem a abertura de janela gráfica do MATLAB.

​

O & garante que o terminal fique livre de volta para sair da sua conta usando exit.

Biblioteca do Roberto

Biblioteca Roberto

*acesso privado*

​

Solicitar acesso para bioinfodiscentes@gmail.com.

SWeep

SWeeP

*acesso privado*

​

Solicitar acesso para bioinfodiscentes@gmail.com.

manage-fasta-files

manage-fasta-files

Monique Schreiner - 04/06/2019

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Funções úteis para lidar com arquivos FASTA no MATLAB como: concatenar fastas, separar um único fasta em vários, retirar sequências de espécies e genes específicos do arquivo fasta, listar espécies, listar gêneros, etc.

​

Algumas funções requerem MATLAB 2017 ou superior.

​

Link aqui

BIOINFO-TOOLS

BIOINFO-TOOLS

Camila P Perico - 16/12/2019

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Ferramentas e funções de Bioinformática e Inteligência Artificial:

  • gaGo - Algoritmo Genético básico - Autor: Prof. Dr. Roberto T Raittz

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Funções compatíveis com MATLAB e, algumas, com OCTAVE

​

Link aqui

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CONTATO

Fone: (41) 3361-4906

Email da secretaria: bioinfocoord@gmail.com

Email dos discentes: bioinfodiscentes@gmail.com

Site oficial do Programa: http://www.bioinfo.ufpr.br/ 

​

​Programa de Pós-Graduação em Bioinformática

Setor de Educação Profissional e Tecnológica

Universidade Federal do Paraná

Rua Alcides Vieira Arcoverde, 1225 - Curitiba - PR - CEP 81520-260

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© 2022  -  Última atualização - Abril 2024

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