I WORKSHOP DE BIOINFORMÁTICA 2019

A Bioinformática pode ser compreendida como a união da Ciência da Computação com a Biologia Molecular, na qual a Computação entra como instrumento para a análise de informação da Biologia, em especial, da Biologia Molecular. Ela consiste basicamente na pesquisa e desenvolvimento de ferramentas computacionais, matemáticas e estatı́stica, com o desenvolvimento e implementação de algoritmos.

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TÓPICOS ABORDADOS:

• Introdução à Bioinformática

• Linux e Shell para bioinformática

• Bancos de dados biológicos

• Montagem genômica

• Anotação genômica

• Filogenia molecular

• Genômica comparativa

PRÉ-REQUISITOS:

• Noções de biologia molecular

• Noções de informática

A linguagem Python é amplamente utilizada em diversas áreas do conhecimento, inclusive na área biológica. Este curso é um primeiro passo para quem tem interesse em aprender esta linguagem e aplicá-la em seus trabalhos. O curso é voltado para iniciantes na linguagem Python e/ou iniciantes na área de programação.

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TÓPICOS ABORDADOS:

• tipos de variáveis, listas e dicionários;

• estrutura condicional (if, else, elif);

• estrutura de repetição (loop for e while).  

• criação de funções;

• manipulação de dados (pandas);

• inferência estatística (scipy.stat);

• criação de gráficos (matplotlib);

• expressões regulares (regex);

• bioinformática (biopython)

PRÉ-REQUISITOS:

• Noções de informática

A linguagem de programação estatística R é uma das ferramentas mais utilizadas em análise e ciência de dados na atualidade. Em bioinformática, milhares de ferramentas são desenvolvidas em R e utilizadas para análises em alto nível de dados genômicos. Neste minicurso, iremos abordar os primeiros passos para utilização da linguagem, abordando importação, manipulação, análise e visualização básica de dados.

TÓPICOS ABORDADOS:

• Objetos no R

• Manejo de Dados

• Gráficos

• Funções

• Estudo de Caso

PRÉ-REQUISITOS:

• Noções de informática

A Inteligência Artificial (IA) abrange o aprendizado de máquina em uma enorme variedade de subcampos. Seus usos vão desde a otimização de processos industriais, até a direção de um carro em uma estrada movimentada. Dentre suas aplicações biológicas, estão: construção de árvores filogenéticas, diagnóstico de doenças, predição de fármacos, identificação de genes. Neste curso abordaremos os principais conceitos da Inteligência Artificial, com práticas utilizando as principais ferramentas open source.

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TÓPICOS ABORDADOS:

• Metaheurística – Algoritmos Genéticos

• Redes Neurais

• Clusterização

• Prática de cada tópico

• Apresentação de ferramentas bioinformáticas desenvolvidas pelo grupo

PRÉ-REQUISITOS:

• Noções de informática

O objetivo deste minicurso é o ensino de métodos para a obtenção e organização de textos científicos, facilitando a revisão bibliográfica de qualquer área do conhecimento. Apresentaremos métodos e ferramentas como Mendeley, scripts, e outras ferramentas usuais.
 

TÓPICOS ABORDADOS:

• Obtenção automática de literatura

• Mendeley

• LaTeX

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PRÉ-REQUISITOS:

• Noções de informática

• Noções de língua inglesa